신이라 불리는 포켓몬을 찾아 신오지방의 모험이 시작된다!!
최고의 포켓몬 트레이너가 되기 위해 다시 모험을 나선 지우와 피카츄는 신오지방에 도착한다. 하지만 그곳에 도착하자마자 호시탐탐 기회를 엿보고 있던 로켓단에게 피카츄가 납치되고 마는데…! 로켓단에게 쫓기고 있는 피카츄를 구해 준 것은 바로 신오지방의 신참 트레이너인 빛나! 피카츄와 빛나, 지우의 운명적인 만남~ 지금, 포켓몬 트레이너의 최강자가 되기 위한 배틀이 펼쳐진다!!